Le Syndicat mixte est la structure juridique qui porte le projet du Parc. Il regroupe les collectivités adhérentes. Il met en oeuvre la charte.

Le Parc naturel régional des Ballons des Vosges est un syndicat mixte ouvert où siègent des élus délégués des collectivités régionales, départementales, communales et intercommunales.

Le syndicat mixte est administré par un comité syndical présidé par un élu et composé de délégués élus tous les 6 ans. Pour prendre ses décisions, le comité syndical s’appuie sur le bureau syndical, 10 vices-présidents, des élus référents par thématiques et plusieurs instances consultatives et de concertation.